Дмитрий Сергеевич Махоня родился в 1985 году в городе Туапсе Краснодарского края. В 1998 году семья переехала во Владивосток. В 18 лет Дмитрий ушёл в армию, после службы работал на стройках: управлял разной специальной техникой.

25 сентября 2022 года он был мобилизован и в составе группы бойцов 155-й отдельной гвардейской ордена Жукова бригады морской пехоты Тихоокеанского флота отправлен для выполнения задач в зоне специальной военной операции. Дмитрий участвовал в боях за Павловку. 26 января 2023 года гвардии сержант Махоня Дмитрий Сергеевич не вернулся из разведки в районе посёлка Южные дачи под Угледаром.

Указом Президента Российской Федерации за мужество и героизм награждён орденом Мужества.